Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEBLO76041 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NEBLO76041 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NEBLO76041 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NEBLO76041 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEBLO76041 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEBLO76041 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NEBLO76041 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NEBLO76041 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms