Protein–RNA interactions for Protein: O76013

KRT36, Keratin, type I cuticular Ha6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT36O76013 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT36O76013 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT36O76013 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT36O76013 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT36O76013 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT36O76013 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT36O76013 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT36O76013 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT36O76013 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT36O76013 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT36O76013 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT36O76013 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT36O76013 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT36O76013 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT36O76013 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT36O76013 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT36O76013 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT36O76013 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms