Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCATO75600 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCATO75600 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCATO75600 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCATO75600 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GCATO75600 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCATO75600 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCATO75600 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCATO75600 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCATO75600 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GCATO75600 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCATO75600 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GCATO75600 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCATO75600 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCATO75600 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCATO75600 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCATO75600 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCATO75600 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCATO75600 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCATO75600 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCATO75600 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCATO75600 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCATO75600 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCATO75600 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCATO75600 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCATO75600 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCATO75600 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms