Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSDE1O75534 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSDE1O75534 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms