Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSO75390 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSO75390 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSO75390 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSO75390 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSO75390 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSO75390 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSO75390 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSO75390 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSO75390 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSO75390 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSO75390 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSO75390 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSO75390 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CSO75390 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms