Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB11FIP3O75154 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB11FIP3O75154 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms