Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC42.51■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC42.47■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
ABCC9O60706 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
ABCC9O60706 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC9O60706 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms