Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EFNA2O43921 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
EFNA2O43921 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms