Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSNA1O43805 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSNA1O43805 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms