Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SYNGR3O43761 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms