Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAPPC3O43617 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAPPC3O43617 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms