Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HOXC11O43248 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HOXC11O43248 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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