Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CRXO43186 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CRXO43186 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CRXO43186 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CRXO43186 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CRXO43186 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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