Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP290O15078 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP290O15078 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP290O15078 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP290O15078 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CEP290O15078 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP290O15078 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP290O15078 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP290O15078 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP290O15078 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CEP290O15078 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CEP290O15078 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CEP290O15078 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms