Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEMA3EO15041 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA3EO15041 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms