Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IFIT3O14879 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFIT3O14879 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms