Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2F3O00716 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2F3O00716 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2F3O00716 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2F3O00716 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
E2F3O00716 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2F3O00716 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms