Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARVCFO00192 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARVCFO00192 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms