Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms