Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
B4E1Z4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
B4E1Z4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E1Z4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E1Z4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E1Z4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E1Z4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E1Z4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E1Z4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E1Z4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
B4E1Z4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
B4E1Z4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
B4E1Z4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
B4E1Z4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
B4E1Z4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
B4E1Z4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E1Z4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E1Z4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E1Z4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E1Z4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E1Z4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E1Z4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E1Z4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
B4E1Z4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
B4E1Z4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4E1Z4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4E1Z4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4E1Z4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4E1Z4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4E1Z4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4E1Z4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
B4E1Z4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
B4E1Z4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms