Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HACD1B0YJ81 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HACD1B0YJ81 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms