Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NPIPB5A8MRT5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NPIPB5A8MRT5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NPIPB5A8MRT5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms