Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PP2D1A8MPX8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PP2D1A8MPX8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms