Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3P2A8K0S8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms