Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTAGE9A4FU28 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTAGE9A4FU28 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms