Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1E9

TRBV7-7, T-cell receptor beta variable 7-7 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TRBV7-7A0A0K0K1E9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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TRBV7-7A0A0K0K1E9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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