Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 BCL2L1-207ENST00000439267 781 ntTSL 211.29□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-204ENST00000420488 820 ntTSL 29.91□□□□□ -0.821e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-206ENST00000434194 381 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 FN1-220ENST00000480024 576 ntTSL 26.21□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EML4-204ENST00000406175 4622 ntTSL 1 (best)6.16□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EML4-207ENST00000480320 1932 ntTSL 24.32□□□□□ -1.721e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.328e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.918e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-201ENST00000464782 640 ntTSL 420.39■□□□□ 0.852e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.712e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.668e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-207ENST00000475734 578 ntTSL 518.9■□□□□ 0.622e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-205ENST00000521399 302 ntTSL 218.84■□□□□ 0.618e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-208ENST00000519418 569 ntTSL 317.23■□□□□ 0.358e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-204ENST00000521127 560 ntTSL 217.16■□□□□ 0.348e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.28e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAPN2-207ENST00000480581 513 ntTSL 216.02■□□□□ 0.168e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-204ENST00000422413 601 ntTSL 315.93■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUCB1-209ENST00000465524 839 ntTSL 515.28■□□□□ 0.048e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.038e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-209ENST00000520368 653 ntTSL 415.19■□□□□ 0.028e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-211ENST00000421589 824 ntTSL 215.1■□□□□ 0.018e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-203ENST00000518099 1159 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.038e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-210ENST00000420216 668 ntTSL 513.79□□□□□ -0.28e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUCB1-210ENST00000469291 582 ntTSL 213.33□□□□□ -0.288e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.298e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-214ENST00000435719 817 ntTSL 312.85□□□□□ -0.358e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-208ENST00000414893 528 ntTSL 312.69□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-209ENST00000417287 610 ntTSL 512.64□□□□□ -0.398e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 USP20-209ENST00000496927 646 ntTSL 512.64□□□□□ -0.398e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-203ENST00000414814 549 ntTSL 512.56□□□□□ -0.48e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-212ENST00000430718 536 ntTSL 412.56□□□□□ -0.48e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC12.5□□□□□ -0.412e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-205ENST00000418745 540 ntTSL 412.47□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-203ENST00000414013 523 ntTSL 312.41□□□□□ -0.422e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-205ENST00000430665 524 ntTSL 512.12□□□□□ -0.472e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-204ENST00000417065 565 ntTSL 411.82□□□□□ -0.528e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-207ENST00000422738 545 ntTSL 411.82□□□□□ -0.528e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-222ENST00000459758 555 ntTSL 411.82□□□□□ -0.528e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DBF4B-206ENST00000527862 1998 ntTSL 1 (best)11.8□□□□□ -0.528e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-209ENST00000604238 1268 ntTSL 510.83□□□□□ -0.682e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 PPT2-EGFL8-205ENST00000479001 944 ntTSL 510.78□□□□□ -0.688e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-206ENST00000419081 591 ntTSL 510.71□□□□□ -0.698e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-208ENST00000426827 756 ntTSL 410.71□□□□□ -0.698e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-207ENST00000452582 637 ntTSL 310.65□□□□□ -0.72e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-207ENST00000414281 772 ntTSL 410.48□□□□□ -0.738e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-219ENST00000452597 603 ntTSL 410.15□□□□□ -0.788e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUCB1-208ENST00000460125 528 ntTSL 29.9□□□□□ -0.828e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-213ENST00000427843 739 ntTSL 59.82□□□□□ -0.848e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-207ENST00000603011 774 ntTSL 59.4□□□□□ -0.92e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-207ENST00000612558 1586 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.968e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-217ENST00000439814 497 ntTSL 49□□□□□ -0.978e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.998e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.062e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-213ENST00000487734 1469 ntTSL 57.96□□□□□ -1.132e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.162e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.272e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-205ENST00000582331 693 ntTSL 36.96□□□□□ -1.38e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-213ENST00000522276 879 ntTSL 36.87□□□□□ -1.318e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-216ENST00000438596 540 ntTSL 56.4□□□□□ -1.388e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-204ENST00000467667 865 ntTSL 36.33□□□□□ -1.42e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-212ENST00000424977 702 ntTSL 56.08□□□□□ -1.448e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-208ENST00000604025 580 ntTSL 25.94□□□□□ -1.462e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HNRNPA2B1-205ENST00000476233 1220 ntTSL 1 (best)5.46□□□□□ -1.542e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.552e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-210ENST00000478006 746 ntTSL 35.26□□□□□ -1.572e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-205ENST00000518684 605 ntTSL 34.99□□□□□ -1.618e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-220ENST00000494656 496 ntTSL 54.59□□□□□ -1.672e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-214ENST00000488107 416 ntTSL 54.35□□□□□ -1.712e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.758e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-223ENST00000497579 878 ntTSL 33.93□□□□□ -1.782e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MBOAT2-206ENST00000474341 713 ntTSL 53.81□□□□□ -1.88e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.898e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-217ENST00000492919 546 ntTSL 23.21□□□□□ -1.92e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 23.13□□□□□ -1.918e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.958e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MBOAT2-202ENST00000460786 550 ntTSL 32.4□□□□□ -2.038e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-215ENST00000524307 3101 ntTSL 21.54□□□□□ -2.168e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MAP3K4-209ENST00000539610 295 ntTSL 30.46□□□□□ -2.348e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.076e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 510□□□□□ -0.816e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.16e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RNASET2-211ENST00000509073 433 ntTSL 27.17□□□□□ -1.266e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ATP2A1-206ENST00000564112 195 ntTSL 34.26□□□□□ -1.736e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 C1GALT1-203ENST00000419721 591 ntTSL 320.1■□□□□ 0.812e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 C1GALT1-206ENST00000467716 458 ntTSL 516.83■□□□□ 0.282e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 511.76□□□□□ -0.532e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 C1GALT1-207ENST00000476068 1186 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.562e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 HEXDC-210ENST00000582131 942 ntTSL 523.75■■□□□ 1.391e-14■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 HEXDC-213ENST00000583354 686 ntTSL 518.81■□□□□ 0.61e-14■□□□□ 8
Retrieved 98 of 48,698 protein–RNA pairs in 3642.2 ms