Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 BCL2L1-207ENST00000439267 781 ntTSL 211.29□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-204ENST00000420488 820 ntTSL 29.91□□□□□ -0.821e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 BCL2L1-206ENST00000434194 381 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 FN1-220ENST00000480024 576 ntTSL 26.21□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EML4-204ENST00000406175 4622 ntTSL 1 (best)6.16□□□□□ -1.421e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 EML4-207ENST00000480320 1932 ntTSL 24.32□□□□□ -1.721e-7■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.328e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.918e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-201ENST00000464782 640 ntTSL 420.39■□□□□ 0.852e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.712e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.668e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-207ENST00000475734 578 ntTSL 518.9■□□□□ 0.622e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-205ENST00000521399 302 ntTSL 218.84■□□□□ 0.618e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-208ENST00000519418 569 ntTSL 317.23■□□□□ 0.358e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-204ENST00000521127 560 ntTSL 217.16■□□□□ 0.348e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.28e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAPN2-207ENST00000480581 513 ntTSL 216.02■□□□□ 0.168e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-204ENST00000422413 601 ntTSL 315.93■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUCB1-209ENST00000465524 839 ntTSL 515.28■□□□□ 0.048e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.038e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-209ENST00000520368 653 ntTSL 415.19■□□□□ 0.028e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-211ENST00000421589 824 ntTSL 215.1■□□□□ 0.018e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-203ENST00000518099 1159 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.038e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-210ENST00000420216 668 ntTSL 513.79□□□□□ -0.28e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUCB1-210ENST00000469291 582 ntTSL 213.33□□□□□ -0.288e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.298e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-214ENST00000435719 817 ntTSL 312.85□□□□□ -0.358e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-208ENST00000414893 528 ntTSL 312.69□□□□□ -0.388e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-209ENST00000417287 610 ntTSL 512.64□□□□□ -0.398e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 USP20-209ENST00000496927 646 ntTSL 512.64□□□□□ -0.398e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-203ENST00000414814 549 ntTSL 512.56□□□□□ -0.48e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-212ENST00000430718 536 ntTSL 412.56□□□□□ -0.48e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC12.5□□□□□ -0.412e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-205ENST00000418745 540 ntTSL 412.47□□□□□ -0.418e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-203ENST00000414013 523 ntTSL 312.41□□□□□ -0.422e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.442e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-205ENST00000430665 524 ntTSL 512.12□□□□□ -0.472e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-204ENST00000417065 565 ntTSL 411.82□□□□□ -0.528e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-207ENST00000422738 545 ntTSL 411.82□□□□□ -0.528e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-222ENST00000459758 555 ntTSL 411.82□□□□□ -0.528e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DBF4B-206ENST00000527862 1998 ntTSL 1 (best)11.8□□□□□ -0.528e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-209ENST00000604238 1268 ntTSL 510.83□□□□□ -0.682e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 PPT2-EGFL8-205ENST00000479001 944 ntTSL 510.78□□□□□ -0.688e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-206ENST00000419081 591 ntTSL 510.71□□□□□ -0.698e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-208ENST00000426827 756 ntTSL 410.71□□□□□ -0.698e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 DPY30-207ENST00000452582 637 ntTSL 310.65□□□□□ -0.72e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-207ENST00000414281 772 ntTSL 410.48□□□□□ -0.738e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-219ENST00000452597 603 ntTSL 410.15□□□□□ -0.788e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 NUCB1-208ENST00000460125 528 ntTSL 29.9□□□□□ -0.828e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-213ENST00000427843 739 ntTSL 59.82□□□□□ -0.848e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-207ENST00000603011 774 ntTSL 59.4□□□□□ -0.92e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-207ENST00000612558 1586 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.968e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-217ENST00000439814 497 ntTSL 49□□□□□ -0.978e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.998e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-209ENST00000477292 1403 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.062e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-213ENST00000487734 1469 ntTSL 57.96□□□□□ -1.132e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-212ENST00000486111 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.162e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-222ENST00000495310 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.272e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CCDC47-205ENST00000582331 693 ntTSL 36.96□□□□□ -1.38e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-213ENST00000522276 879 ntTSL 36.87□□□□□ -1.318e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TTLL3-216ENST00000438596 540 ntTSL 56.4□□□□□ -1.388e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-204ENST00000467667 865 ntTSL 36.33□□□□□ -1.42e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 CAP1-212ENST00000424977 702 ntTSL 56.08□□□□□ -1.448e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MICU1-208ENST00000604025 580 ntTSL 25.94□□□□□ -1.462e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 HNRNPA2B1-205ENST00000476233 1220 ntTSL 1 (best)5.46□□□□□ -1.542e-9■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.552e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-210ENST00000478006 746 ntTSL 35.26□□□□□ -1.572e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-205ENST00000518684 605 ntTSL 34.99□□□□□ -1.618e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-220ENST00000494656 496 ntTSL 54.59□□□□□ -1.672e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-214ENST00000488107 416 ntTSL 54.35□□□□□ -1.712e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.758e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-223ENST00000497579 878 ntTSL 33.93□□□□□ -1.782e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MBOAT2-206ENST00000474341 713 ntTSL 53.81□□□□□ -1.88e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.898e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TFDP2-217ENST00000492919 546 ntTSL 23.21□□□□□ -1.92e-12■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RPL23A-207ENST00000578181 593 ntTSL 23.13□□□□□ -1.918e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.958e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MBOAT2-202ENST00000460786 550 ntTSL 32.4□□□□□ -2.038e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 TBC1D31-215ENST00000524307 3101 ntTSL 21.54□□□□□ -2.168e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 MAP3K4-209ENST00000539610 295 ntTSL 30.46□□□□□ -2.348e-6■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.076e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 510□□□□□ -0.816e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 FBXL4-202ENST00000369244 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.16e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 RNASET2-211ENST00000509073 433 ntTSL 27.17□□□□□ -1.266e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 ATP2A1-206ENST00000564112 195 ntTSL 34.26□□□□□ -1.736e-10■□□□□ 8.1
EFTUD2Q15029 C1GALT1-203ENST00000419721 591 ntTSL 320.1■□□□□ 0.812e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 C1GALT1-206ENST00000467716 458 ntTSL 516.83■□□□□ 0.282e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 C1GALT1-204ENST00000429911 802 ntTSL 511.76□□□□□ -0.532e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 C1GALT1-207ENST00000476068 1186 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.562e-11■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 HEXDC-210ENST00000582131 942 ntTSL 523.75■■□□□ 1.391e-14■□□□□ 8
EFTUD2Q15029 HEXDC-213ENST00000583354 686 ntTSL 518.81■□□□□ 0.61e-14■□□□□ 8
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