Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
A3GALT2U3KPV4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A3GALT2U3KPV4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms