Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AUP1Q9Y679 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AUP1Q9Y679 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms