Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GTF3C3Q9Y5Q9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms