Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB12Q9Y5F1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms