Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF1Q9Y548 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF1Q9Y548 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms