Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KIF3AQ9Y496 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KIF3AQ9Y496 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms