Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHTOPQ9Y3Y2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms