Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HCN4Q9Y3Q4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
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HCN4Q9Y3Q4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HCN4Q9Y3Q4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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