Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL11Q9Y3B7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL11Q9Y3B7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL11Q9Y3B7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms