Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CAB39Q9Y376 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CAB39Q9Y376 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms