Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNX24Q9Y343 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX24Q9Y343 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms