Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
APOBEC2Q9Y235 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOBEC2Q9Y235 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms