Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTN6Q9UQ52 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTN6Q9UQ52 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms