Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
L1RE1Q9UN81 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms