Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX12Q9UMY4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX12Q9UMY4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms