Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNPO2Q9UMS6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNPO2Q9UMS6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms