Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB23Q9ULC3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB23Q9ULC3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms