Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF180Q9UJW8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms