Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPS1Q9UHF7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRPS1Q9UHF7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms