Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LAMTOR3Q9UHA4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LAMTOR3Q9UHA4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LAMTOR3Q9UHA4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms