Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APEX2Q9UBZ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms