Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLKQ9UBT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLKQ9UBT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLKQ9UBT6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms