Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS29Q9UBQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VPS29Q9UBQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VPS29Q9UBQ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms